Ciência em Ação

Linhas de Pesquisa

O Laboratório de Fitoquímica e Farmacognosia integra farmacognosia clássica às mais modernas ferramentas analíticas para investigar a biodiversidade química de organismos naturais.

01
GNPS UHPLC-Orbitrap MS/MS Desreplicação MZmine

Metabolômica de Produtos Naturais

Aplicação de redes moleculares e análise não direcionada para mapear a diversidade química de extratos naturais.

Utilizamos LC-MS/MS para obter perfis metabolômicos detalhados de extratos de plantas, fungos e algas, integrando dados com bibliotecas espectrais globais (GNPS, MassBank, HMDB).

Esta linha tem permitido a descoberta acelerada de novas substâncias e a priorização racional de frações bioativas, encurtando drasticamente o tempo de bancada no processo de bioprospecção.

Molecular Networking Visualização de famílias de compostos via GNPS e FBMN
Bancos de Dados Integração com GNPS, MassBank, HMDB e LOTUS
Análise Multivariada PCA, PLS-DA e OPLS-DA para discriminação de amostras
Ferramentas Computacionais MZmine, SIRIUS, MetaboAnalyst e CANOPUS

Farmacognosia & Produtos Naturais

Isolamento, elucidação estrutural e caracterização de compostos bioativos de organismos naturais.

Realizamos extração, fracionamento bioguiado e isolamento de compostos puros por técnicas cromatográficas (CCDP, CC clássica, CLAE preparativa e cromatografia em contracorrente — CCC) a partir de plantas medicinais, fungos endofíticos e invertebrados marinhos.

Os compostos isolados são caracterizados por espectroscopia de RMN de ¹H, ¹³C, correlações bidimensionais (COSY, HSQC, HMBC, NOESY) e espectrometria de massas de alta resolução, com determinação de configuração absoluta por dicroísmo circular (ECD) e cálculos de DFT.

Classes estudadas incluem alcaloides indólicos e isoquinolínicos, terpenoides (sesqui-, di- e triterpenoides), flavonoides, taninos condensados (proantocianidinas), lignanas e policetídeos.

Técnicas Cromatográficas CLAE prep., CCC, CC clássica e CCDP
RMN Multidimensional ¹H, ¹³C, COSY, HSQC, HMBC, NOESY
Classes de Compostos Alcaloides, terpenoides, flavonoides, taninos
Configuração Absoluta ECD experimental e cálculo de DFT/TD-DFT
02
RMN 2D Alcaloides Terpenoides ECD/DFT CCC
03
ESI-MS/MS Orbitrap MALDI-IMS DESI IMS

Espectrometria de Massas Aplicada

Desenvolvimento de métodos, fontes de ionização e bancos de dados espectrais para identificação de metabólitos naturais.

O grupo tem tradição no desenvolvimento e aperfeiçoamento de métodos de espectrometria de massas para a análise de produtos naturais. Investigamos regras de fragmentação de classes de metabólitos, desenvolvemos bancos de dados de espectros MS/MS e criamos ferramentas computacionais para anotação estrutural.

Trabalhamos com múltiplas fontes de ionização (ESI, APCI, MALDI, DESI) e analisadores de alta resolução (Orbitrap, Q-TOF, FT-ICR-MS), explorando técnicas como MSⁿ, separação de isômeros e espectrometria de mobilidade iônica (IMS).

O laboratório contribui ativamente com a plataforma GNPS com bibliotecas de espectros de produtos naturais brasileiros, e aplica MALDI Imaging Mass Spectrometry (MALDI-IMS) para o mapeamento espacial de metabólitos em tecidos vegetais.

Alta Resolução Orbitrap, Q-TOF e FT-ICR-MS para fórmula molecular exata
MALDI Imaging (IMS) Distribuição espacial de metabólitos em tecidos vegetais
Ionização Ambiente DESI e DART para análise direta sem preparo de amostra
Biblioteca Espectral Contribuição de espectros MS/MS ao GNPS e MassBank

Atividades Biológicas & Bioprospecção

Do campo ao bioensaio: coleta, triagem e avaliação da atividade antimicrobiana, antiparasitária e antifúngica de produtos naturais da biodiversidade brasileira.

Esta linha integra a bioprospecção de espécies do Cerrado, Amazônia e Mata Atlântica com a avaliação sistemática das atividades biológicas de extratos e compostos isolados. O fluxo vai da expedição de campo à triagem metabolômica (redes moleculares GNPS) e aos bioensaios de alta performance, seguindo rigorosamente a legislação SISGEN (Lei nº 13.123/2015).

Atividade Antimicrobiana

Avaliação de extratos e compostos isolados frente a bactérias multirresistentes (MRSA, Klebsiella pneumoniae KPC, Acinetobacter baumannii) e fungos de relevância clínica (Candida, Cryptococcus). Determinação de CIM/CBM por microdiluição em caldo (CLSI), atividade anti-biofilme e sinergismo com antibióticos convencionais.

MRSA CIM/CBM Biofilme Candida CLSI
Atividade Antiparasitária

Triagem de produtos naturais contra parasitas de doenças negligenciadas: Leishmania amazonensis, Trypanosoma cruzi e Plasmodium falciparum. Determinação de IC₅₀ por citometria de fluxo e microscopia fluorescente, com cálculo do índice de seletividade. Colaboração com o IMTSP/USP.

Leishmaniose Chagas Malária IC₅₀ Citometria
Bioprospecção da Biodiversidade Brasileira

Expedições científicas regulares ao Cerrado, Amazônia e Mata Atlântica para coleta de plantas e fungos endofíticos. Identificação botânica com exsicatas depositadas no Herbário SPF-USP. Triagem por redes moleculares e bioensaios HTS para priorização de espécies e frações de interesse farmacológico.

Cerrado Amazônia Mata Atlântica SISGEN HTS
04
Antimicrobiana Antiparasitária Bioprospecção HTS SISGEN
Antimicrobiana MRSA, KPC, biofilme, Candida — métodos CLSI
Antiparasitária Leishmania, Trypanosoma, Plasmodium — IC₅₀ & IS
Bioprospecção Cerrado, Amazônia, Mata Atlântica — SISGEN & HTS
Alta Performance Redes moleculares GNPS + bioensaios HTS integrados

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